V roce 1891 vznikla Hospodářská jednota pro okres kloboucký, která usilovala o založení školy pro vzdělávání rolnické mládeže. Roku 1903 se připojil Zemský moravský spolek vinařský s plánem na zřízení ovocnicko-vinařské školy. Tyto plány však byly tehdejším ministerstvem zamítnuty, protože již existovala německá škola podobného zaměření.
Po vzniku Československé republiky se plány na školu znovu obnovily a roku 1920 byla škola v Kloboukách založena. Zpočátku fungovala v provizorních prostorách, ale v roce 1930 získala svou vlastní budovu, která je součástí školy dodnes.
Ředitel Hamřík definoval smysl školy takto: „Škola má synům rolníků dát odborné vzdělání, aby mohli spravovat své hospodářství a být platnými občany společnosti.” Tato vize je stále aktuální i dnes.
Během nacistické okupace byla škola nucena učit nový obor – hospodyňskou školu pro dívky. Po osvobození Klobouk zde byla zřízena vojenská nemocnice kvůli přítomnosti vojenského velitelství.
Rok 1948 přinesl změny s nástupem kolektivizace. Zvýšené nároky na kvalifikaci zemědělců vedly k rozvoji zemědělského školství. V roce 1954 byla škola rozšířena o mistrovskou školu a přistavena sousední budova bývalého okresního soudu.
Prvním maturitním oborem byla od roku 1958 dvouletá zemědělská technická škola. Díky rostoucímu počtu studentů byla v roce 1960 postavena nová školní budova a v letech 1961-1962 byla dostavěna tělocvična a domov mládeže.
Od sedmdesátých let až do devadesátých studovali ve škole studenti z Afriky, Asie a Střední Ameriky. Škola má tak absolventy po celém světě.
V devadesátých letech se původní obory pěstitelství a chovatelství spojily a vznikl nový obor agropodnikání. Postupně byly zavedeny i obory obchodní akademie a informatika v ekonomice, což reagovalo na potřebu odborníků v těchto oblastech.
Škola dnes nabízí tři obory: Agropodnikání, Informační technologie a Obchodní akademie. Výuka je průběžně modernizována a škola je vybavena nejnovějšími technologiemi a pomůckami.